国家从一开始就要求，合作医疗的基金必须是封闭运行。要专帐专户管理，防止挪用。去年国家审计署专门对合作医疗基金进行了审计。从审计情况来看，绝大多数地区都是按照国家帐目封闭运行的要求，基金管理不错，但是也发生几个地方在基金的管理上还有漏洞。

　　毛群安说，新型农村合作医疗基金一定要支付到一个合适的比例，既要保证这个基金不出现大的透支，同时又要保证给农民较大比例的报销。现在由于这个制度在各地都是处于试点阶段，确定的报销比例以及报销办法，各地还不尽相同。每年收取费用的基金，因为合作医疗管理上最大的难题，就是要把这个基金运作好，钱收好、管理好，在合作医疗基金使用上不能发生问题，这是合作医疗试点自始至终关注的一个焦点问题，就是要把基金用好，保证它用在补贴农民的医疗费上。所以在今年的试点当中，卫生部把基金的管理以及基金使用情况的监督检查作为工作的重点。